Как да конвертирате Sequence да Fasta

Една обща цел при медицински изследвания включва идентифициране на грешки, или мутации в ДНК последователност, която може да причини генетично заболяване, свързано . Технологии и компютърни науки са напреднали генетични изследвания до ниво, където хиляди данни последователност могат да бъдат анализирани едновременно. Една уговорка на нова софтуер е предварително конвертиране на данни последователност в FASTA формат. FASTA е подобен на обикновен текстов формат. Тя позволява на множество данни, които трябва да бъдат събрани в един файл и ускорява анализ. Въпреки това, повечето инструменти за генериране на последователност файлове в текстов формат. Преобразуване на текст в FASTA формат е прост процес , използвайки текстов редактор софтуер. Нещата ще трябва
Computer
Текстов редактор програма на MarketBook.bg Покажи повече инструкции

1

Отворете определена ДНК последователност текстов файл с помощта на програма за редактиране на текст . Това би било Text Editor За Macintosh и Note Pad за съвместими системи Windows . Оригиналната последователност текстови файлове могат да имат алтернатива разширение като сл. за данни, генерирани на Applied Biosystems автоматизирана генетичен анализатор.

2

Започнете първия ред , като напишете> последвано от идентификатор на последователност . Колкото по-голяма , отколкото символ обозначава FASTA формат за програми, които анализират FASTA данни. Няма специфични правила по отношение на идентификатора толкова дълго, тъй като няма никакви пространства. Един пример за приемлив влизане на първата ви линия е> Cat_Isomerase_Exon3 .


3

Натиснете " Return" , за да създадете нов ред и да започне на втория ред.
<Бразилски> 4

Започнете данни за последователността на втора линия. Насоки FASTA формат изискват ДНК текстови данни следните Международния съюз за чиста и приложна химия , IUPAC , кодове . Всеки ред е ограничен до 80 знака , представляващи 80 ДНК бази и могат да бъдат големи или малки . Едно приемливо влизане включително смесени бази е AGCTTCGTGG ... CVTGCGTTGT .

5

Натиснете " Return" ключа за да започне на следващия ред на данни за последователността . Всеки ред трябва да се състои от 80 бази , представлявани от кода IUPAC .

6

Запазете файла с помощта на разширението на TXT файл или съответното разширение FASTA файл. Програми, които обработват FASTA форматирани данни често изискват специфично разширение FASTA като FSA , Фна , FFN или FRN .