AutoDock Atom Видове

AutoDock е образователна платформа, която използва познатите атоми и интерфейс мрежа в комбинация с приложения за свързване да се предскаже скоростта на свързване на повечето малки молекули. Това дава възможност на студентите да учат почти молекула задължителен , без да изисква скъпо лабораторно време и обучение. Елементи

AutoDock подкрепя основните елементи: Н , С, N, О , F , Mg , P , S , Cl, Ca , Mn , Fe , Zn , Вг и I. Те са parametrized в рамките на програмата, така че тя признава техните физически характеристики, качества и реакции към други елементи. Тези основни елементи могат да бъдат използвани за образуване на молекула и тествани с обвързващо прилагане или разтворител . За пример , един студент ще покаже два водородни молекули на една молекула кислород , H2O и ще бъде в състояние да тествате тази молекула вода срещу неговата степен на свързване .


Обвързващата

AutoDock поддържа множество обвързващи или докинг химикали и елементи , името и или етикета на докинг елемент трябва да бъде въведен в потребителския интерфейс , за да намерите и изберете подходящия елемент. AutoDock осигурява система от инструменти, предназначени да помогнат на оглед , да се следят и да ускорете процеса на свързване. Те включват рентгенова кристалография , основана на структура лекарствен дизайн , олово оптимизация, виртуален скрининг ( HTS ) , комбинаторна библиотека дизайн , протеин - протеин докинг и химически механизъм проучвания . Това позволява на студентите да работят с елементите и да ги свържат при различни условия , така че да могат да бъдат постигнати най-добрите и най-точните резултати от изпитване .