Определяне на генотипа Tools

Генетични изследователи имат комбинирани усилия за определяне на цялата генетична последователност , 9 милиарда бази , намерени в човешкия геном. Геномът е съдържанието на ДНК намерени във всяка човешка клетка , състояща се от повтарящи азотни бази , означени като " А ", " G ", " С" и " Т. " Генетика изследвания продължават да търсят различия в различни човешки геноми , както и различни видове за еволюционни изследвания. Медицински генетични изследвания са заинтересовани в намирането на генетични аномалии или генетични вариации , които могат да причинят заболяване . Генотипа е метод за определяне на генетична вариация без последователност на целия геном. Изследователите изолират малки региони на генома да търсят разлики площ , в резултат на различен брой на азотни основи . Различни базови брой може да бъде причинено от генетична аномалия , която води до заболявания като диабет , болест на Алцхаймер и рак . Инструментите , използвани за извършване на генотип приложения са еволюирали и са разработени за бързо и точно да определят индивидуален генотип . Полимеразна верижна реакция

Развитието на генно инженерство произхожда от развитие на полимеразно-верижна реакция , или PCR . Този метод позволява на изследователите да усилят или да правят копия на малките региони на генома в рамките на часове . Районът на интерес се определя чрез прибавяне на къси ДНК молекули --- грундове , които съвпадат с началото и края на региона на интереси.

PCR се превърна в безценен инструмент в генетичните изследвания . Усилване на същия регион от различни индивиди осигурява метод за сравнение. Идентификация Forensics момента използва 15 отделни региони за сравнение. Един регион може да се сравнява в различни хора . Въпреки това, няма двама души , трябва да съответстват на всички 15 области .


Електрофореза в агарозен гел

PCR е метод за усилване на определени региони на ДНК. Въпреки това, не се осигурява метод за сравнение действителния размер на фрагментите . Продуктите от PCR се разделят по размер с помощта на гел -подобен материал, наречен " агароза. " Малки фрагменти мигрират по- бързо през агароза в отговор на електрически ток в процес, наречен " агарозна гел електрофореза . "

След PCR фрагменти са натоварени на агарозата и мигрират по гел , когато се прилага електрически ток . Ethidium бромид позволява фрагменти, за да се види, когато под ултравиолетова светлина. Електрофореза в агарозен гел осигурява метод за бързо определяне на успешното PCR както доближава размер фрагмент . Въпреки това, недостатък на агарозен като средство за определяне на генотипа е, че фрагменти трябва да бъдат значително различни по размер за точни резултати. Agarose не осигурява добра среда за сравняване на различни фрагменти от една единствена база. Продажба и Наем на Автоматизирани секвенсери и генетични Анализатори

Fluorescent белязан ДНК фрагменти , записани от автоматизиран секвенсер .

Автоматизирани секвенсери и генетични анализатори са се превърнали в основен инструмент, използван при определяне на генотипа . Те позволяват фрагменти , различни от един азотна база , трябва да се определят бързо и евтино . Както с агарозна гел електрофореза на ДНК фрагменти се усилват от първата PCR . Въпреки това , един праймер е маркиран с флуоресцентно багрило добавяне на цвят на фрагмента . Пробите се разделят по размер чрез миграция чрез гел - полимер като в отговор на електрически ток . Малки фрагменти се движат по-бързо от по-големите фрагменти . Тъй като фрагменти мигрират към края на полимера , цифров фотоапарат записва цвета и изпраща информация към компютър за анализ . Автоматизирано секвениране оборудване в момента се използва в съдебномедицинската идентификация и тестване бащинство .


Next Generation секвенсери също Определете генотипове

инструменти от следващо поколение за секвениране бързо се появиха през 2006 г. насам . This технология съчетава PCR амплификация и секвениране заедно , за да се определи милиони бази в едно и също време . Процесът започва с PCR; обаче , различни праймери са обвързани с перли се смесват в една реакция позволява хиляди региони да бъдат амплифицирани в едно и също време .

следващо поколение секвенсери след това се разделят на фрагменти с размер и позволяват множество ДНК региони да бъдат анализирани. Методът е неблагоприятна като инструмент за определяне на генотипа , когато изследователите са заинтересовани в сравняване на един регион на генома . Предимството е, че генома изолира от една клетка осигурява достатъчно материал за PCR амплификация . Сравнявайки генотиповете на нормални и анормални клетки , изолирани от един-единствен човек може да помогне за идентифициране на ракови клетки и потенциалните лечения.